ABDULİLAH ECE
Turkish Journal of Pharmaceutical Sciences - 2016;13(2):241-248
p90 Ribozomal kinazlar serin/treonin protein kinaz ailesindendir ve kanser hücrelerinin çoğalmasında rol aldıkları saptanmıştır. Yüksek seçiciliğe sahip inhibiötlerin ve aynı zamanda bu inhibitörlerin mekanizmalarına ait yapısal bilgilerin eksikliği, bu alanda ilerlemeyi kısıtlamaktadır. Uygun bir RSK kristal yapısı olmadan yapılan in siliko protein-inhibitör çalışmalarında da yanlış sonuçlara varıldığı söylenmiştir. Bu çalışmada, yeni çözümlenen, en etkili ve seçici RSK inhibitörlerinden LJH685 ile kompleks halinde olan, yüksek çözünürlükteki RSK2 kristal yapısı kullanılarak, RSK2’ye ait ilk efarmakofor modeli oluşturulmuştur. Büyük veri tabanlarının (144 milyondan fazla konformasyona sahip yaklaşık 7 milyon bileşik) sanal taraması, ardından bir dizi moleküler kenetleme çalışması ve kritik bağlanma modlarının görsel olarak incelenmesi çalışmalarının birleştirilmesi ile 12 bileşik umut vaat eden etkili ve seçici inhibitörler olarak önerilmiştir. Bu bileşikler arasından 5777208 ve 5919607’nin kayda değer kenetlenme skorlarının ve bağlanma etkileşimlerinin olduğu bulunmuştur.
