Özlem Karaca Ocak, Zoha Naeem
Batı Karadeniz Tıp Dergisi - 2026;10(1):9-24
Amaç: Lazer sonrası yara enfeksiyonu, hemoroid cerrahisi sonrası tekrarlayan bir komplikasyondur, çünkü anorektal ortamda polimikrobiyal flora kolonize olur ve mukozal onarım bozulur. Bu çalışma, mevcut tedavi seçeneklerinin dezavantajlarını ortadan kaldırmayı ve anorektal yara onarımının mikroçevresinin özel koşullarını karşılamak üzere izlenen, antimikrobiyal aktiviteye sahip yeni nesil bir profilaktik biyomolekül sağlamayı amaçlamaktadır. Gereç ve Yöntemler: Enfeksiyon ve yavaş yara iyileşmesi gibi bu iki sorunu aşmak için, mevcut bir çalışmada, seçilen antimikrobiyal peptidleri (AMP'ler) fibroblast büyüme faktörü 10 (FGF10) alanıyla birleştiren yeni bir antimikrobiyal-büyüme faktörü füzyon proteini tasarlamak ve karakterize etmek için bir in-silico biyomühendislik müdahalesi geliştirilmiştir. Bulgular: Antimikrobiyal Peptid Veritabanı, AP00608, AP02570, AP03795 ve AP00952 dahil olmak üzere dört katyonik AMP ile taranmış ve AllerTOP v2.0 ve ToxiPred kullanılarak taranarak alerjenik ve toksik olmadıkları doğrulanmıştır. Elde edilen mühendislik füzyon yapısı, istenen fizikokimyasal özelliklere (32,84 kDa; pI 10,19; kararsızlık indeksi 38,52; GRAVY -0,33; çözünürlük 0,48) ve bu da yüksek stabilite ve hidrofiliklik anlamına gelmektedir. İkincil yapı tahmini %27,34 alfa sarmal ve %16,26 beta sarmal gösterirken, AlphaFold olasılığı ve ERRAT (%94,28 yapısal doğruluk kanıtladı). ClusPro 2.0, FGFR2b (1NUN) ve FGFR2 (1EV2) ile sırasıyla -1161,9 kcal mol -1 ve -1144,4 kcal mol -1 enerjilerle iyi bağlanma afiniteleri gösterdi. 500 ikonik Desmond moleküler dinamik simülasyonu, termodinamik stabiliteyi, kompakt katlanmayı ve kompleksler içindeki hidrojen bağlarının korunmasını belirledi. Sonuç: Tüm bu bulgular, önerilen füzyon yapısının, lazer sonrası hemoroidal yaralarda mikrobiyal kolonizasyonu önleyen ve epitel onarımını uyaran çift etkili bir tedavi yöntemi olarak kullanılma potansiyeline sahip olduğunu göstermektedir. Bu hesaplamalı araştırma, bu nedenle gelecekte çok işlevli yara iyileştirici biyolojik ürünlerin deneysel olarak doğrulanması ve translasyonel geliştirilmesinin temelini oluşturmaktadır.
