Yasemin ÇAKIR, Banu LEBE
Developments and Experiments in Health and Medicine - 2026;40(3):367-377
AMAÇ Çalışmamızda, TCGA (Kanser Genom Atlası) verilerini kullanarak, melanomlarda CDKN2A homozigot delesyonu varlığı ile klinikopatolojik özellikler, immun hücre infiltrasyonları ve sağkalım arasındaki ilişkiyi araştırmayı amaçladık. GEREÇ YÖNTEM Klinikopatolojik parametreler ve sağkalım süreleri, cBioPortal web sitesindeki "TCGA, Firehose Legacy" veri seti (www.cbioportal.org) kullanılarak CDKN2A homozigot delesyonu olan ve olmayan hastalar arasında karşılaştırıldı. Ayrıca, delesyon durumu ile BRA F ve NRAS genlerindeki mutasyon varlığı arasındaki ilişki değerlendirildi. İmmun hücresi infiltrasyonu analizleri TIMER veritabanı (http://timer.comp -genomics.org/timer/) kullanılarak gerçekleştirildi. P ve q < 0,05 istatistiksel olarak anlamlı kabul edildi. BULGULAR CDKN2A homozigot delesyonu olan ve olmayan hastalar arasında yaş, Breslow kalınlığı, T evresi, ülserasyon varlığı, tümör mutasyon yükü gibi klinikopatolojik parametreler ve BRAF/NRAS mutasyon durumu açısından anlamlı fark yoktu (p > 0,05). CDKN 2A delesyonu olan hastalarda hastalıksız sağkalım daha uzun (medyan: 56, 33 ve 50, 13 ay, sırasıyla) (p = 0,0235, q = 0,0469), iken iki grup arasında genel sağkalımda anlamlı bir fark yoktu (p > 0,05). TIMER veritabanı analizi, CDKN2A homozigot delesyonun varlığı ile CD4 pozitif T lenfosit, B lenfosit ve dendritik hücre infiltrasyonu arasında negatif bir korelasyon olduğunu ortaya koyarken, makrofaj infiltrasyonu ile pozitif bir korelasyon mevcuttu (p < 0,05). SONUÇ CDKN2A homozigot delesyonu, klinikopatolojik parametreler veya BRAF/NRAS mutasyonlarıyla anlamlı bir ilişki göstermemiştir. Bununla birlikte, CDKN2A delesyonunun hastalıksız sağkalımla ilişkili olabileceği, ancak genel sağkalımı etkilemediği görülmüş olup, bu bulgunun tümör mikroçevresi ve immün yanıt bağlamında daha geniş bir çerçevede değerlendirilmesi gerekmektedir.
