RİYADİ SUMIRTANURDIN, SHAFİRA SUNGKAR, YASARAH HISPRASTIN, KENNY DWİ SIDHARTA, DEA DİAN NURHIKMAH
Turkish Journal of Pharmaceutical Sciences - 2020;17(4):417-423
Amaç: Siklin bağımlı kinaz 2 (CDK2) hücre siklusunun regülasyonunda rol alan bir proteindir ve yüksek derecede ekspresyonu kontrol edilemeyen hücre proliferasyonuna yardımcı olur. CDK2’nin inhibisyonu birçok anti-kanser ilacının etki mekanizmasıdır. Kurkumin Curcuma longa’nın aktif bileşenidir ve siklin D, siklin E, CDK4 ve CDK6’yı inhibe ettiği rapor edilmiştir. Bu çalışmanın amacı bir moleküler modelleme yaklaşımı ile CDK2’yi hedefleyerek daha aktif kurkumin türevlerinin tasarlanmasıdır. Gereç ve Yöntemler: Moleküler modelleme yaklaşımı bir reseptör ve ligand hazırlanması, yöntem validasyonu, farmakofor modellemesi ve kenetleme simülasyonu içermektedir. Bulgular: Moleküler kenetleme simülasyonunun sonucu kurkumin, kurkumod 23 ve 24’ün serbest bağlanma enerjilerinin (ΔG) sırasıyla -7, 80, -9, 15 ve -9, 36 kcal/mol olduğunu göstermiştir. Kurkumod 23 ve 24’ün CDK ile hidrojen etkileşimi Lys33 kalıntısı üzerinde olmaktadır ki bu CDK2’yi inhibe eden bileşiklerin potansiyel etkileşim bölgesi kabul edilmektedir. Farmakofor modelleme, kurkumod 23 ve 24’ün farmakofor-uyma değerlerini sırasıyla %45, 20 ve %47, 26 olarak göstermiştir. Sonuç: Bu çalışmanın sonuçları CDK2 reseptöründeki amino asit kalıntılarıyla bu iki türevin etkileşimine dayanarak kurkumod 23 ve 24’ün kurkuminin CDK2 antagonisti olan en iyi ve en potent modifikasyonları olduğunu işaret etmektedir.
